MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 40374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021738	ATC	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655724
2	NC_021738	T	7	7	750	756	0 %	100 %	0 %	0 %	525655724
3	NC_021738	GCT	2	6	866	871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655724
4	NC_021738	TAA	2	6	930	935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655724
5	NC_021738	TGT	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
6	NC_021738	T	6	6	2233	2238	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
7	NC_021738	GTTG	2	8	2337	2344	0 %	50 %	50 %	0 %	525655725
8	NC_021738	TTA	2	6	2351	2356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
9	NC_021738	CTC	2	6	2508	2513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655725
10	NC_021738	GTA	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
11	NC_021738	TTG	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
12	NC_021738	CGG	2	6	2627	2632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655725
13	NC_021738	T	6	6	2666	2671	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
14	NC_021738	TTG	2	6	2710	2715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
15	NC_021738	TAG	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
16	NC_021738	TATC	2	8	2832	2839	25 %	50 %	0 %	25 %	525655725
17	NC_021738	GGTT	2	8	2865	2872	0 %	50 %	50 %	0 %	525655725
18	NC_021738	TGT	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
19	NC_021738	GCT	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655725
20	NC_021738	TTTG	2	8	2955	2962	0 %	75 %	25 %	0 %	525655725
21	NC_021738	GCAGA	2	10	2994	3003	40 %	0 %	40 %	20 %	525655725
22	NC_021738	AAT	2	6	3067	3072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
23	NC_021738	TCA	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
24	NC_021738	TTGC	2	8	3099	3106	0 %	50 %	25 %	25 %	525655725
25	NC_021738	TTA	2	6	3126	3131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
26	NC_021738	CTT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
27	NC_021738	TTGT	2	8	3222	3229	0 %	75 %	25 %	0 %	525655725
28	NC_021738	GTTT	2	8	3230	3237	0 %	75 %	25 %	0 %	525655725
29	NC_021738	ATTTT	2	10	3239	3248	20 %	80 %	0 %	0 %	525655725
30	NC_021738	AAT	2	6	3250	3255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
31	NC_021738	CTGC	2	8	3273	3280	0 %	25 %	25 %	50 %	525655725
32	NC_021738	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
33	NC_021738	GTC	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655725
34	NC_021738	TTTC	2	8	3450	3457	0 %	75 %	0 %	25 %	525655725
35	NC_021738	T	6	6	3491	3496	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
36	NC_021738	TAAA	2	8	3558	3565	75 %	25 %	0 %	0 %	525655725
37	NC_021738	ATT	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
38	NC_021738	CTT	2	6	3654	3659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
39	NC_021738	T	6	6	3668	3673	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
40	NC_021738	TAG	2	6	3679	3684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
41	NC_021738	GAT	2	6	3771	3776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
42	NC_021738	GAT	2	6	3841	3846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
43	NC_021738	TTG	2	6	3851	3856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
44	NC_021738	GTT	2	6	3989	3994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
45	NC_021738	TTTGC	2	10	4022	4031	0 %	60 %	20 %	20 %	525655725
46	NC_021738	GTT	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
47	NC_021738	TAA	2	6	4185	4190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
48	NC_021738	TTTA	2	8	4276	4283	25 %	75 %	0 %	0 %	525655725
49	NC_021738	CAT	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
50	NC_021738	CAA	2	6	4390	4395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655725
51	NC_021738	ACC	2	6	4399	4404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655725
52	NC_021738	TCC	2	6	4435	4440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655725
53	NC_021738	TTGC	2	8	4611	4618	0 %	50 %	25 %	25 %	525655725
54	NC_021738	GAAA	2	8	4631	4638	75 %	0 %	25 %	0 %	525655725
55	NC_021738	ATA	2	6	4672	4677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
56	NC_021738	CTG	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655725
57	NC_021738	TAT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
58	NC_021738	TAC	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
59	NC_021738	TTC	2	6	5034	5039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
60	NC_021738	TTCC	2	8	5130	5137	0 %	50 %	0 %	50 %	525655725
61	NC_021738	T	6	6	5168	5173	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
62	NC_021738	T	6	6	5188	5193	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
63	NC_021738	CGA	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
64	NC_021738	TGCACC	2	12	5275	5286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525655725
65	NC_021738	CTA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
66	NC_021738	ATT	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
67	NC_021738	AG	3	6	5441	5446	50 %	0 %	50 %	0 %	525655725
68	NC_021738	AATTG	2	10	5469	5478	40 %	40 %	20 %	0 %	525655725
69	NC_021738	TAT	2	6	5493	5498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
70	NC_021738	T	6	6	5527	5532	0 %	100 %	0 %	0 %	525655725
71	NC_021738	TCATA	2	10	5631	5640	40 %	40 %	0 %	20 %	525655725
72	NC_021738	AAT	2	6	5721	5726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
73	NC_021738	GTT	2	6	5807	5812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
74	NC_021738	TTA	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
75	NC_021738	CTTT	2	8	5819	5826	0 %	75 %	0 %	25 %	525655725
76	NC_021738	GAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655725
77	NC_021738	TTC	2	6	5878	5883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
78	NC_021738	GGCA	2	8	5926	5933	25 %	0 %	50 %	25 %	525655725
79	NC_021738	ATTT	2	8	5949	5956	25 %	75 %	0 %	0 %	525655725
80	NC_021738	GAG	2	6	5961	5966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525655725
81	NC_021738	CCT	2	6	5987	5992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655725
82	NC_021738	CAA	2	6	6018	6023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655725
83	NC_021738	GCA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
84	NC_021738	TAT	2	6	6093	6098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
85	NC_021738	ACTA	2	8	6106	6113	50 %	25 %	0 %	25 %	525655725
86	NC_021738	TTG	2	6	6212	6217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
87	NC_021738	CAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
88	NC_021738	ACA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655725
89	NC_021738	CAG	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
90	NC_021738	AAG	2	6	6351	6356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655725
91	NC_021738	AAC	2	6	7512	7517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655726
92	NC_021738	TTA	2	6	7542	7547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655726
93	NC_021738	AGA	2	6	7556	7561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655726
94	NC_021738	CAA	2	6	7626	7631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655726
95	NC_021738	GGT	2	6	7644	7649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655726
96	NC_021738	A	6	6	7691	7696	100 %	0 %	0 %	0 %	525655726
97	NC_021738	TGA	2	6	7703	7708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655726
98	NC_021738	TGT	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655726
99	NC_021738	CAG	2	6	7807	7812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655726
100	NC_021738	TCA	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655726
101	NC_021738	TAT	2	6	7901	7906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655726
102	NC_021738	AAGA	2	8	7941	7948	75 %	0 %	25 %	0 %	525655726
103	NC_021738	AC	3	6	7980	7985	50 %	0 %	0 %	50 %	525655726
104	NC_021738	CAA	2	6	8052	8057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655726
105	NC_021738	TGC	2	6	8123	8128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655726
106	NC_021738	TTTA	2	8	8248	8255	25 %	75 %	0 %	0 %	525655726
107	NC_021738	GAA	2	6	8369	8374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655726
108	NC_021738	TAT	2	6	8427	8432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655726
109	NC_021738	TGCTCT	2	12	8953	8964	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525655727
110	NC_021738	ATT	2	6	9003	9008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655727
111	NC_021738	CTT	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655727
112	NC_021738	TCA	2	6	9025	9030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655727
113	NC_021738	TTG	2	6	9045	9050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655727
114	NC_021738	A	6	6	9063	9068	100 %	0 %	0 %	0 %	525655727
115	NC_021738	CTGT	2	8	9112	9119	0 %	50 %	25 %	25 %	525655727
116	NC_021738	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655727
117	NC_021738	ATC	2	6	9225	9230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655727
118	NC_021738	TTC	2	6	9260	9265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655727
119	NC_021738	ATA	2	6	9357	9362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655727
120	NC_021738	A	6	6	9430	9435	100 %	0 %	0 %	0 %	525655727
121	NC_021738	ATC	2	6	9540	9545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655727
122	NC_021738	GAC	2	6	9625	9630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655727
123	NC_021738	AAT	2	6	9662	9667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655727
124	NC_021738	TGC	2	6	9705	9710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655727
125	NC_021738	AATTCT	2	12	9712	9723	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525655727
126	NC_021738	GTG	3	9	9737	9745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655727
127	NC_021738	TAT	2	6	9758	9763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655727
128	NC_021738	ATTCA	2	10	9780	9789	40 %	40 %	0 %	20 %	525655727
129	NC_021738	CTAG	2	8	9883	9890	25 %	25 %	25 %	25 %	525655727
130	NC_021738	CTGTA	2	10	9971	9980	20 %	40 %	20 %	20 %	525655727
131	NC_021738	CTG	2	6	10017	10022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655727
132	NC_021738	AGA	2	6	10092	10097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655727
133	NC_021738	TCA	2	6	10163	10168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655727
134	NC_021738	TAA	2	6	10178	10183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655728
135	NC_021738	TCA	2	6	10212	10217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655728
136	NC_021738	GTA	2	6	10274	10279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655728
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139	NC_021738	ATC	3	9	11184	11192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655614
140	NC_021738	GCA	2	6	11242	11247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655614
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143	NC_021738	AATAC	2	10	11515	11524	60 %	20 %	0 %	20 %	525655614
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254	NC_021738	T	6	6	17458	17463	0 %	100 %	0 %	0 %	525655731
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257	NC_021738	TTC	2	6	17523	17528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655731
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261	NC_021738	TTA	2	6	17812	17817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655732
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263	NC_021738	CCA	2	6	17888	17893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655732
264	NC_021738	TGGC	2	8	17939	17946	0 %	25 %	50 %	25 %	525655732
265	NC_021738	GAA	2	6	17968	17973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655732
266	NC_021738	AC	3	6	18192	18197	50 %	0 %	0 %	50 %	525655732
267	NC_021738	ACC	2	6	18217	18222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655732
268	NC_021738	A	6	6	18380	18385	100 %	0 %	0 %	0 %	525655732
269	NC_021738	CAA	2	6	18415	18420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655732
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273	NC_021738	ATT	2	6	18704	18709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655733
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278	NC_021738	AAT	2	6	18885	18890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655734
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283	NC_021738	CAC	2	6	19468	19473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655735
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296	NC_021738	A	6	6	20021	20026	100 %	0 %	0 %	0 %	525655735
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392	NC_021738	TGC	2	6	24893	24898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655740
393	NC_021738	GCT	2	6	25011	25016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655740
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